# fasta34 -b 10 -v 10 MET30p /data/blast/swissprot FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t23 March 18, 2004 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query library MET30p vs /data/blast/swissprot library searching /data/blast/swissprot library 1>>>YIL046W Chr 9 - 640 aa vs /data/blast/swissprot library opt E() < 20 384 0:== 22 1 0:= one = represents 239 library sequences 24 0 0: 26 5 3:* 28 22 34:* 30 183 206:* 32 698 796:===* 34 1909 2158:======== * 36 4294 4432:==================* 38 7619 7325:==============================*= 40 11080 10218:==========================================*==== 42 12941 12490:====================================================*== 44 14337 13778:=========================================================*== 46 14336 14033:==========================================================*= 48 13609 13435:========================================================* 50 12208 12260:===================================================* 52 10377 10778:============================================ * 54 9008 9206:======================================* 56 7397 7690:=============================== * 58 6126 6314:==========================* 60 4826 5114:=====================* 62 3810 4100:================ * 64 3111 3261:=============* 66 2544 2577:==========* 68 1899 2027:========* 70 1469 1589:======* 72 1193 1241:=====* 74 925 968:====* 76 723 753:===* 78 539 586:==* 80 431 455:=* 82 301 348:=* 84 220 276:=* 86 187 213:* 88 123 165:* inset = represents 8 library sequences 90 127 128:* 92 112 99:* :============*= 94 64 76:* :======== * 96 60 59:* :=======* 98 36 46:* :=====* 100 27 35:* :====* 102 21 27:* :===* 104 20 21:* :==* 106 20 16:* :=*= 108 9 13:* :=* 110 20 10:* :=*= 112 7 8:* :* 114 10 6:* :*= 116 11 5:* :*= 118 9 4:* :*= >120 367 3:*= :*======================================= 55022948 residues in 149755 sequences statistics sampled from 60000 to 149394 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1190+/-0.000196; mu= 12.2733+/- 0.011 mean_var=75.8301+/-15.113, 0's: 146 Z-trim: 259 B-trim: 1227 in 1/65 Lambda= 0.147283 Kolmogorov-Smirnov statistic: 0.0142 (N=29) at 48 FASTA (3.47 Mar 2004) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, gap-pen: -12/-2, width: 16 Scan time: 12.070 The best scores are: opt bits E(149755) gi|730077|sp|P39014|MT30_YEAST MET30 protein ( 640) 4407 946.3 0 gi|3122851|sp|Q00659|SCOB_EMENI Sulfur metabolite ( 678) 880 196.8 3.6e-49 gi|3122852|sp|Q01277|SCO2_NEUCR Sulfur controller ( 650) 780 175.6 8.7e-43 gi|3183289|sp|P87053|POF1_SCHPO F-box/WD-repeat p ( 605) 686 155.6 8.5e-37 gi|13124267|sp|Q9UKB1|FW1B_HUMAN F-box/WD-repeat ( 542) 634 144.5 1.7e-33 gi|13124271|sp|Q9Y297|FW1A_HUMAN F-box/WD-repeat ( 605) 622 142.0 1.1e-32 gi|3122986|sp|Q91854|TRCB_XENLA Beta-TrCP (Beta-t ( 518) 617 140.9 2e-32 gi|20532311|sp|Q8YRI1|YY46_ANASP Hypothetical WD- (1526) 589 135.3 2.7e-30 gi|44887884|sp|Q8VBV4|FBW7_MOUSE F-box/WD-repeat ( 629) 536 123.7 3.4e-27 gi|44887885|sp|Q969H0|FBW7_HUMAN F-box/WD-repeat ( 707) 535 123.6 4.3e-27 >>gi|730077|sp|P39014|MT30_YEAST MET30 protein (640 aa) initn: 4407 init1: 4407 opt: 4407 Z-score: 5058.8 bits: 946.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 4407; 100.000% identity (100.000% ungapped) in 640 aa overlap (1-640:1-640) 10 20 30 40 50 60 YIL046 MRRERQRMMSFEDKDKDDLDNSNSNNSSEMTDTAMMPPLKRLLITGSSDDLAQGSSGKKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 MRRERQRMMSFEDKDKDDLDNSNSNNSSEMTDTAMMPPLKRLLITGSSDDLAQGSSGKKK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 YIL046 MTMATRSPSSSPDLATNDSGTRVQPLPEYNFTKFCYRHNPDIQFSPTHTACYKQDLKRTQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 MTMATRSPSSSPDLATNDSGTRVQPLPEYNFTKFCYRHNPDIQFSPTHTACYKQDLKRTQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 YIL046 EINANIAKLPLQEQSDIHHIISKYSNSNDKIRKLILDGILSTSCFPQLSYISSLVTHMIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 EINANIAKLPLQEQSDIHHIISKYSNSNDKIRKLILDGILSTSCFPQLSYISSLVTHMIK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 YIL046 IDFISILPQELSLKILSYLDCQSLCNATRVCRKWQKLADDDRVWYHMCEQHIDRKCPNCG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 IDFISILPQELSLKILSYLDCQSLCNATRVCRKWQKLADDDRVWYHMCEQHIDRKCPNCG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 YIL046 WGLPLLHMKRARIQQNSTGSSSNADIQTQTTRPWKVIYRERFKVESNWRKGHCRIQEFKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 WGLPLLHMKRARIQQNSTGSSSNADIQTQTTRPWKVIYRERFKVESNWRKGHCRIQEFKG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 YIL046 HMDGVLTLQFNYRLLFTGSYDSTIGIWDLFTGKLIRRLSGHSDGVKTLYFDDRKLITGSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 HMDGVLTLQFNYRLLFTGSYDSTIGIWDLFTGKLIRRLSGHSDGVKTLYFDDRKLITGSL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 YIL046 DKTIRVWNYITGECISTYRGHSDSVLSVDSYQKVIVSGSADKTVKVWHVESRTCYTLRGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 DKTIRVWNYITGECISTYRGHSDSVLSVDSYQKVIVSGSADKTVKVWHVESRTCYTLRGH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 YIL046 TEWVNCVKLHPKSFSCFSCSDDTTIRMWDIRTNSCLKVFRGHVGQVQKIIPLTIKDVENL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 TEWVNCVKLHPKSFSCFSCSDDTTIRMWDIRTNSCLKVFRGHVGQVQKIIPLTIKDVENL 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 YIL046 ATDNTSDGSSPQDDPTMTDGADESDTPSNEQETVLDENIPYPTHLLSCGLDNTIKLWDVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 ATDNTSDGSSPQDDPTMTDGADESDTPSNEQETVLDENIPYPTHLLSCGLDNTIKLWDVK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 YIL046 TGKCIRTQFGHVEGVWDIAADNFRIISGSHDGSIKVWDLQSGKCMHTFNGRRLQRETQHT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 TGKCIRTQFGHVEGVWDIAADNFRIISGSHDGSIKVWDLQSGKCMHTFNGRRLQRETQHT 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 YIL046 QTQSLGDKVAPIACVCIGDSECFSGDEFGCVKMYKFDLND :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|730 QTQSLGDKVAPIACVCIGDSECFSGDEFGCVKMYKFDLND 610 620 630 640 >>gi|3122851|sp|Q00659|SCOB_EMENI Sulfur metabolite repr (678 aa) initn: 1608 init1: 840 opt: 880 Z-score: 1008.1 bits: 196.8 E(): 3.6e-49 Smith-Waterman score: 1627; 41.351% identity (48.269% ungapped) in 607 aa overlap (92-636:95-676) 70 80 90 100 110 120 YIL046 TMATRSPSSSPDLATNDSGTRVQPLPEYNFTKFCYRHNPDIQFSPTHTACYKQ-DLKRTQ .:.:::: :: . : .: : . gi|312 VAPFLARHIPEQYAPLGAQSILPADLSSANSKYCYRHRPDQK-------CRRQADEPSMD 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 YIL046 EINANIAKLPLQEQSDIHHIISKYSNSNDKIRKLILDGILSTSCFPQLSYISSLVTHMIK ... .. .:: .:..: :. : .: . : :::::.::.. :::::::::. : .:. gi|312 KLQRELESLPQGDQQSISHVWSLFSAAPAKHRKLILQGIMAQCCFPQLSYISATVRDLIR 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 YIL046 IDFISILPQELSLKILSYLDCQSLCNATRVCRKWQKLADDDRVWYHMCEQHIDRKCPNCG ::::. :: :...::: ::: :::.:..: : :. ::::: ::..:::::: ::: .:: gi|312 IDFITALPPEIAFKILCYLDTTSLCKASQVSRGWRALADDDVVWHRMCEQHIHRKCKKCG 180 190 200 210 220 230 250 YIL046 WGLPLLHMKRAR--------------------------------------------IQQN :::::: :: : .... gi|312 WGLPLLDRKRLRESKREIELRATTWDKGVVGPRSPDASAESPPSGKRKLEDDEVAVVKRH 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 YIL046 STGSSSNADIQTQTT------RPWKVIYRERFKVESNWRKGHCRIQEFKGHMDGVLTLQF .. .:.: .. .. :::: .:..:::: .::. :.: :. :::: .::. ::: gi|312 CSSLGSDAGVDKDSDFFKTRYRPWKEVYKDRFKVGTNWKYGRCSIKTFKGHTNGVMCLQF 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 YIL046 NYRLLFTGSYDSTIGIWDLFTGKLIRRLSGHSDGVKTLYFDDRKLITGSLDKTIRVWNYI . .: :::::.:: ::: ::. .: : :: .:.. : ::: :::.::.:.::.:::. gi|312 EDNILATGSYDTTIKIWDTETGEELRTLRGHESGIRCLQFDDTKLISGSMDRTIKVWNWR 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 YIL046 TGECISTYRGHSDSVLSVDSYQKVIVSGSADKTVKVWHVESRTCYTLRGHTEWVNCVKLH :::::::: :: .:... ....:::.:::::.:. :... ..:::::.::: :.. gi|312 TGECISTYTGHRGGVIGLHFDASILASGSVDKTVKIWNFEDKSTFSLRGHTDWVNAVRVD 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 YIL046 PKSFSCFSCSDDTTIRMWDIRTNSCLKVFRGHVGQVQKIIPLTIK------DVENLATD- .: . :: ::: :.:.::. :..:...:.:::::::...:: . :.: : gi|312 TSSRTVFSASDDCTVRLWDLDTKTCIRTFHGHVGQVQQVVPLPREFEFEEHDAECENDDL 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 YIL046 --NTSDGSSPQDDPTMTDGADESDTPSNEQETVLDEN--IPYPTHLLSCGLDNTIKLWDV ...:.. :. . .: . . . :. : .:.. : : .... .::.::.::.. gi|312 STTSGDANPPSIQASMGLEPNAAYSQSSAFGTSFDNGRAAP-PRYMVTSALDSTIRLWET 540 550 560 570 580 590 540 550 560 570 580 590 YIL046 KTGKCIRTQFGHVEGVWDIAADNFRIISGSHDGSIKVWDLQSGKCMHTFNGRRLQRETQH ::.:.:: :::.:::: ..::..::.::..: ::.:: ..::: .::.: : gi|312 TTGRCLRTFFGHLEGVWALGADTLRIVSGAEDRMIKIWDPRTGKCERTFTG--------H 600 610 620 630 640 600 610 620 630 640 YIL046 TQTQSLGDKVAPIACVCIGDSECFSGDEFGCVKMYKFDLND . .:..:. .:::. .:.: :.::.: gi|312 S---------GPVTCIGLGDSRFATGSEDCEVRMYSFQS 650 660 670 >>gi|3122852|sp|Q01277|SCO2_NEUCR Sulfur controller-2 (S (650 aa) initn: 1595 init1: 714 opt: 780 Z-score: 893.6 bits: 175.6 E(): 8.7e-43 Smith-Waterman score: 1430; 38.315% identity (46.257% ungapped) in 629 aa overlap (92-636:41-645) 70 80 90 100 110 120 YIL046 TMATRSPSSSPDLATNDSGTRVQPLPEYNFTKFCYRHNPDIQFSPTHTACYKQ-DLKRTQ .:.::::.:: . : . : . gi|312 TPFLREHIPSIYAPIGKPGNQETARAENPNSKYCYRHHPD-------SKCRRAADKAKMV 20 30 40 50 60 130 140 150 160 170 180 YIL046 EINANIAKLPLQEQSDIHHIISKYSNSNDKIRKLILDGILSTSCFPQLSYISSLVTHMIK :.... :: .:. . :. : .: . . : :.:.:::: ::::::..: :.. .: gi|312 MIQSELDKLTSADQQAVTHVWSLFSAAPARHRDLMLQGILSQLCFPQLSFVSREVNEALK 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 240 YIL046 IDFISILPQELSLKILSYLDCQSLCNATRVCRKWQKLADDDRVWYHMCEQHIDRKCPNCG ::::: :: ::. :.: ::: :: .:..: ..:. :::.: :: .:::::..::: .:: gi|312 IDFISALPVELAQKVLCYLDTVSLTKAAQVSQRWRTLADSDAVWVRMCEQHVNRKCTKCG 130 140 150 160 170 180 250 260 YIL046 WGLPLLHMKRAR--IQQ--------------------------NSTGSSSNADIQ----- ::::::. :. : .: :. :. :. . gi|312 WGLPLLERKKLRNYTRQRQLAKGGPQGRVTELADSHDSQDRSVNQHGKRPAAEAEEEDPI 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 YIL046 ---------------TQT-TRPWKVIYRERFKVESNWRKGHCRIQEFKGHMDGVLTLQFN :: :: ::..::.:..: ::.... ... .::: .:: ::.. gi|312 KKRQCMAAAEASKAVTQPKTRSWKAVYRDRWQVSYNWKNSRYKLSVLKGHENGVTCLQLD 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 YIL046 YRLLFTGSYDSTIGIWDLFTGKLIRRLSGHSDGVKTLYFDDRKLITGSLDKTIRVWNYIT .: :::::.:: ::.. : . :: : ::. :...: ::: :::.::::.::.:::. : gi|312 DNILATGSYDTTIKIWNIETEECIRTLVGHTAGIRALQFDDSKLISGSLDHTIKVWNWHT 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 YIL046 GECISTYRGHSDSVLSVDSYQKVIVSGSADKTVKVWHVESRTCYTLRGHTEWVNCVKLHP :::.::. .:.:::.:: ....:::.:::::.. .:. : :.::..::: ... gi|312 GECLSTFAAHTDSVISVHFDGHLLASGSSDKTVKIFDFNSKETYCLKGHSDWVNSTHVDI 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 YIL046 KSFSCFSCSDDTTIRMWDIRTNSCLKVFRGHVGQVQKIIPLTIK-----DVENLATDNTS :: . :: ::::::..::. : . .....::::.::... : . .: : :..... gi|312 KSRTVFSASDDTTIKLWDLDTRQVIRTYEGHVGHVQQVLILPPEYEPDEEVLNGASQDNQ 430 440 450 460 470 480 490 500 510 YIL046 DG----SSPQDDPTMTDGADE----------------SDTPSNEQET--------VLDEN :. :. . .:.:. . : :. ::..... : ::. gi|312 DAMSVSSGGSGSPSMSHAQIERAGSPGSHSSSHNLLPSSLPSGDEDVRHLYGSAFVADES 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 YIL046 IPYPT-HLLSCGLDNTIKLWDVKTGKCIRTQFGHVEGVWDIAADNFRIISGSHDGSIKVW : : .... :::.:..::: ::.:.:: :::.::::..:.:..:.:::..:: .:.: gi|312 RPLPPRYFMTGGLDSTMRLWDSATGRCLRTLFGHLEGVWSLAGDTIRVISGANDGMVKTW 550 560 570 580 590 600 580 590 600 610 620 630 YIL046 DLQSGKCMHTFNGRRLQRETQHTQTQSLGDKVAPIACVCIGDSECFSGDEFGCVKMYKFD . .:::: :..: : .:..:: ..:: ::.: : .....: gi|312 EPRSGKCDATYTG--------HC---------GPVTCVGLSDSLMASGSEDGTIRLHSFK 610 620 630 640 640 YIL046 LND gi|312 PCRQ 650 >>gi|3183289|sp|P87053|POF1_SCHPO F-box/WD-repeat protei (605 aa) initn: 1331 init1: 686 opt: 686 Z-score: 786.0 bits: 155.6 E(): 8.5e-37 Smith-Waterman score: 1237; 37.968% identity (47.545% ungapped) in 561 aa overlap (122-637:48-540) 100 110 120 130 140 150 YIL046 TKFCYRHNPDIQFSPTHTACYKQDLKRTQEINANIAKLPLQEQSDIHHIISKYSNSNDKI .. ... : . .. .. . . .:... . gi|318 APRAELWQRHLLEKKEGDQSISVSAFNISSMHNELSGLSEKSRQRVEAVWAAFSEASCSE 20 30 40 50 60 70 160 170 180 190 200 210 YIL046 RKLILDGILSTSCFPQLSYISSLVTHMIKIDFISILPQELSLKILSYLDCQSLCNATRVC ::: :.:::.. ::. :: . ....::.:.:: :.:..:::.:: .:::.:..: gi|318 RKLALQGILNNCSSSLLSFASSTLDSLVRLDFLSLLPVEISFRILSFLDARSLCQAAQVS 80 90 100 110 120 130 220 230 240 YIL046 RKWQKLADDDRVWYHMCEQHIDRKCPNCGWGLPLLH------------------------ ..:..::::: .:..::::::.::: .::::::::. gi|318 KHWKELADDDVIWHRMCEQHINRKCEKCGWGLPLLERNTLYAAKASIQKRYERLTKRGVD 140 150 160 170 180 190 250 260 270 280 YIL046 -------MKRARIQQNSTGS-----------SSNADIQ---TQTTRPWKVIYRERFKVES .:.:.... :.: : :.: . ::::: .: :: .:: gi|318 QAHESSPVKKAKLDDYPTSSNEETISSVKPPSPNSDSKFFLPFKTRPWKEVYAERCRVEC 200 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 YIL046 NWRKGHCRIQEFKGHMDGVLTLQFNYRLLFTGSYDSTIGIWDLFTGKLIRRLSGHSDGVK :::.:.:: ..:: :::. ::. .: .::::.:: .:.: : . . : :::.:: gi|318 NWRHGRCRQVVLSGHSDGVMCLQLVRNILASGSYDATIRLWNLATFQQVALLEGHSSGVT 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 YIL046 TLYFDDRKLITGSLDKTIRVWNYITGECISTYRGHSDSVLSVDSYQKVIVSGSADKTVKV : ::. :::.::.:::::.::: :.:::: .::.:::: . . ..:::::: :::. gi|318 CLQFDQCKLISGSMDKTIRIWNYRTSECISILHGHTDSVLCLTFDSTLLVSGSADCTVKL 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 YIL046 WHVESRTCYTLRGHTEWVNCVKLHPKSFSCFSCSDDTTIRMWDIRTNSCLKVFRGHVGQV :: . :::::: :: :.. .: :::.::..:...::.::..: .:.: : gi|318 WHFSGGKRITLRGHTGPVNSVRIIRDRGLVLSGSDDSTIKIWSLETNTCLHTFSAHIGPV 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 YIL046 QKIIPLTIKDVENLATDNTSDGSSPQDDPTMTDGADESDTPSNEQETVLDENIPYPTHLL :. :.. : ..:. gi|318 QS---LALAD----------------------------------------------SRLF 440 530 540 550 560 570 580 YIL046 SCGLDNTIKLWDVKTGKCIRTQFGHVEGVWDIAADNFRIISGSHDGSIKVWDLQSGKCMH ::.::.::: ::.. ::..: :::.::::.::::..:.:::.::: .:::. . .:.: gi|318 SCSLDGTIKQWDIEKKKCVHTLFGHIEGVWEIAADHLRLISGAHDGVVKVWE--ACECVH 450 460 470 480 490 500 590 600 610 620 630 640 YIL046 TFNGRRLQRETQHTQTQSLGDKVAPIACVCIGDSECFSGDEFGCVKMYKFDLND :... :.. :.. : .:: : ::.: : . .. :. gi|318 TLKN--------HSE---------PVTSVALGDCEVVSGSEDGKIYLWLFNNAPNESPVS 510 520 530 540 gi|318 TQSVPISSLNGQRSNSSVQRALSSVPNYSSSLSNISTRNLNIPPSNANNDDVSIQS 550 560 570 580 590 600 >>gi|13124267|sp|Q9UKB1|FW1B_HUMAN F-box/WD-repeat prote (542 aa) initn: 979 init1: 287 opt: 634 Z-score: 727.0 bits: 144.5 E(): 1.7e-33 Smith-Waterman score: 649; 30.357% identity (36.516% ungapped) in 504 aa overlap (132-609:70-514) 110 120 130 140 150 160 YIL046 IQFSPTHTACYKQDLKRTQEINANIAKLPLQEQSDIH-HIISKYSNSNDKIRKLILDGIL :...:. . ....:.: :... ... .. gi|131 QSMPSVRCLQISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSES-DQVE--FVEHLI 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 YIL046 STSCFPQLSYISSLVTHMIKIDFISILPQE----LSLKILSYLDCQSLCNATRVCRKWQK : : : ..:.: . :.. :::. ::.. .. .:::::: .::: : ::..::. gi|131 SRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQR 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 YIL046 LADDDRVWYHMCEQHIDRKCPNCGWGLPLLHMKRARIQQNSTGSSSNADIQTQTTRPWKV . .. .: .. :. . : : : : .:. : . ... .. . gi|131 VISEGMLWKKLIERMV-RTDPL--W--KGLSERRGWDQYLFKNRPTDGPPNSFYRSLYPK 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 YIL046 IYRERFKVESNWRKG-HC--RIQEFKGHMDGVLTLQFNYRLLFTGSYDSTIGIWDLFTGK : .. .::::: : : ::: . . :: ::.. . ...: :..: ::: . . gi|131 IIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLE 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 YIL046 LIRRLSGHSDGVKTLYFDDRKLITGSLDKTIRVWNYITGECISTYRGHSDSVLSVDSYQK .. :.::. .: : .:.: ..::: :.:.:::. ::: ..: :...:: . . gi|131 CLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNG 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 YIL046 VIVSGSADKTVKVWHVESRTCYTLR----GHTEWVNCVKLHPKSFSCFSCSDDTTIRMWD ..:. : :... :: . : : ::: :: :: : . : . : : : ::..:. gi|131 LMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYI--VSASGDRTIKVWS 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 YIL046 IRTNSCLKVFRGHVGQVQKIIPLTIKDVENLATDNTSDGSSPQDDPTMTDGADESDTPSN : .... :: . : : .: :... ::: gi|131 TSTCEFVRTLNGHK---RGIACLQYRD--RLVVS----GSS------------------- 390 400 410 420 510 520 530 540 550 560 YIL046 EQETVLDENIPYPTHLLSCGLDNTIKLWDVKTGKCIRTQFGHVEGVWDIAADNFRIISGS ::::.:::.. : :.:. :: : : : :: ::.::. gi|131 ---------------------DNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGA 430 440 450 460 570 580 590 600 610 YIL046 HDGSIKVWDLQ---------SGKCMHTF---NGR--RLQRETQHTQTQSLGDKVAPIACV .::.::::::: : :..:. .:: ::: . . ..: : . gi|131 YDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFL 470 480 490 500 510 520 620 630 640 YIL046 CIGDSECFSGDEFGCVKMYKFDLND gi|131 NVPPSAQNETRSPSRTYTYISR 530 540 >>gi|13124271|sp|Q9Y297|FW1A_HUMAN F-box/WD-repeat prote (605 aa) initn: 519 init1: 331 opt: 622 Z-score: 712.5 bits: 142.0 E(): 1.1e-32 Smith-Waterman score: 631; 30.876% identity (38.750% ungapped) in 502 aa overlap (143-609:143-577) 120 130 140 150 160 170 YIL046 KQDLKRTQEINANIAKLPLQEQSDIHHIISKYSNSNDKIRKLILDGILSTSCFPQLSYIS ..:.: :... ... ..: : : ..:. gi|131 NGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSES-DQVE--FVEHLISQMCHYQHGHIN 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 YIL046 SLVTHMIKIDFISILP----QELSLKILSYLDCQSLCNATRVCRKWQKLADDDRVWYHMC : . :.. :::. :: .... .:::::: .::: : ::..: ....: .: .. gi|131 SYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLI 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 YIL046 EQHIDRKC------PNCGWGLPLLHMKRARIQQNSTGSSSNADIQTQTTRPWKVIYRERF :. . ::: :.. : ..:: .. . : .. gi|131 ERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNK---------PPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 YIL046 KVESNWRKG-------HCRIQEFKGHMDGVLTLQFNYRLLFTGSYDSTIGIWDLFTGKLI .::::: : ::: . :: : ::.. . . .: :.:: ::: : . gi|131 TIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKG----VYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECK 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 YIL046 RRLSGHSDGVKTLYFDDRKLITGSLDKTIRVWNYITGECISTYRGHSDSVLSVDSYQKVI : :.::. .: : .:.: .:::: :.:.:::. ::: ..: : ..:: . . .. gi|131 RILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMM 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 YIL046 VSGSADKTVKVWHVESRTCYTLR----GHTEWVNCVKLHPKSFSCFSCSDDTTIRMWDIR :. : :... :: . : : ::: :: :: : . : . : : : ::..:. gi|131 VTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYI--VSASGDRTIKVWNTS 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 YIL046 TNSCLKVFRGHVGQVQKIIPLTIKDVENLATDNTSDGSSPQDDPTMTDGADESDTPSNEQ : .... :: . : : .: :... ::: gi|131 TCEFVRTLNGH---KRGIACLQYRD--RLVVS----GSS--------------------- 460 470 480 520 530 540 550 560 570 YIL046 ETVLDENIPYPTHLLSCGLDNTIKLWDVKTGKCIRTQFGHVEGVWDIAADNFRIISGSHD ::::.:::.. : :.:. :: : : : :: ::.::..: gi|131 -------------------DNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYD 490 500 510 520 580 590 600 610 YIL046 GSIKVWDL--------QSGK-CMHTF---NGR--RLQRETQHTQTQSLGDKVAPIACVCI :.:::::: .: :..:. .:: ::: . . ..: : . gi|131 GKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLND 530 540 550 560 570 580 620 630 640 YIL046 GDSECFSGDEFGCVKMYKFDLND gi|131 PAAQAEPPRSPSRTYTYISR 590 600 >>gi|3122986|sp|Q91854|TRCB_XENLA Beta-TrCP (Beta-transd (518 aa) initn: 519 init1: 331 opt: 617 Z-score: 707.7 bits: 140.9 E(): 2e-32 Smith-Waterman score: 640; 29.350% identity (36.543% ungapped) in 569 aa overlap (83-609:8-506) 60 70 80 90 100 110 YIL046 QGSSGKKKMTMATRSPSSSPDLATNDSGTRVQPLPEYNFTKFCYRHNPDIQFSPTHTACY .:: : . . : : .: : . gi|312 MEGFSCSLQP-PTASEREDCNRDEP-----PRKIITE 10 20 30 120 130 140 150 160 YIL046 KQDLKRTQEINANIAKL-PLQEQSDIHH-----IISKYSNSNDKIRKL-ILDGILSTSCF :. :..:. :.. . . : :.. . .. . :: .. .. .. ... ..: : gi|312 KNTLRQTKLANGTSSMIVPKQRKLSANYEKEKELCVKYFEQWSECDQVEFVEHLISRMCH 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 YIL046 PQLSYISSLVTHMIKIDFISILP----QELSLKILSYLDCQSLCNATRVCRKWQKLADDD : ..:.. . :.. :::. :: .... .:::::: .:::.: ::..: ....: gi|312 YQHGHINTYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCSAELVCKEWYRVTSDG 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 YIL046 RVWYHMCEQHIDRKC------PNCGWGLPLLHMKRARIQQNSTGSSSNADIQTQTTRPWK .: .. :. . ::: :.. : :.. .. .. : : gi|312 MLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNK------PPDGKTPPNSFY-RALYP-K 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 YIL046 VIYRERFKVESNWRKG-------HCRIQEFKGHMDGVLTLQFNYRLLFTGSYDSTIGIWD .: .. .::::: : ::: . : :: ::.. . . .: :.:: ::: gi|312 II-QDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSK----GVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWD 210 220 230 240 250 330 340 350 360 370 380 YIL046 LFTGKLIRRLSGHSDGVKTLYFDDRKLITGSLDKTIRVWNYITGECISTYRGHSDSVLSV : . : : ::. .: : .:.: .:::: :.:.:::. ::: ..: : ..:: . gi|312 KNTLECKRVLMGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHL 260 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 440 YIL046 DSYQKVIVSGSADKTVKVWHVESRTCYTLR----GHTEWVNCVKLHPKSFSCFSCSDDTT . ..:. : :... :: . : : ::: :: :: : . : . : : : : gi|312 RFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYI--VSASGDRT 320 330 340 350 360 370 450 460 470 480 490 500 YIL046 IRMWDIRTNSCLKVFRGHVGQVQKIIPLTIKDVENLATDNTSDGSSPQDDPTMTDGADES :..:. : .... :: . : : .: :... ::: gi|312 IKVWNTSTCEFVRTLNGHK---RGIACLQYRD--RLVVS----GSS-------------- 380 390 400 410 510 520 530 540 550 560 YIL046 DTPSNEQETVLDENIPYPTHLLSCGLDNTIKLWDVKTGKCIRTQFGHVEGVWDIAADNFR ::::.:::.. : :.:. :: : : : :: : gi|312 --------------------------DNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKR 420 430 440 570 580 590 600 610 YIL046 IISGSHDGSIKVWDL--------QSGK-CMHTF---NGR--RLQRETQHTQTQSLGDKVA :.::..::.:::::: .: :..:. .:: ::: . . ..: : . gi|312 IVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTIL 450 460 470 480 490 500 620 630 640 YIL046 PIACVCIGDSECFSGDEFGCVKMYKFDLND gi|312 IWDFLNDPGLA 510 >>gi|20532311|sp|Q8YRI1|YY46_ANASP Hypothetical WD-repea (1526 aa) initn: 720 init1: 189 opt: 589 Z-score: 669.2 bits: 135.3 E(): 2.7e-30 Smith-Waterman score: 589; 30.058% identity (33.016% ungapped) in 346 aa overlap (256-590:999-1324) 230 240 250 260 270 280 YIL046 HMCEQHIDRKCPNCGWGLPLLHMKRARIQQNSTGSSSNADIQTQTTRPWKVIYRERFKVE : :: . ::.: : . . : . gi|205 DQTVRLWDISSGECLYIFQGHTGWVYSVAFNLDGSMLATGSGDQTVRLWDISSSQCFYI- 970 980 990 1000 1010 1020 290 300 310 320 330 340 YIL046 SNWRKGHCRIQEFKGHMDGVLTLQFNYR--LLFTGSYDSTIGIWDLFTGKLIRRLSGHSD :.:: . : .. :. .: .:: :.:. .::. .:. . :.::.. gi|205 ------------FQGHTSCVRSVVFSSDGAMLASGSDDQTVRLWDISSGNCLYTLQGHTS 1030 1040 1050 1060 1070 350 360 370 380 390 YIL046 GVKTLYF--DDRKLITGSLDKTIRVWNYITGECISTYRGHSDSV--LSVDSYQKVIVSGS :... : : : .:. :. .:.:. .:.:. : .:... : : . ....:: gi|205 CVRSVVFSPDGAMLASGGDDQIVRLWDISSGNCLYTLQGYTSWVRFLVFSPNGVTLANGS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 400 410 420 430 440 450 YIL046 ADKTVKVWHVESRTC-YTLRGHTEWVNCVKLHPKSFSCFSCSDDTTIRMWDIRTNSCLKV .:. :..: . :. : :::.:::.::: : . : . . : : : :.:.::: ...:: . gi|205 SDQIVRLWDISSKKCLYTLQGHTNWVNAVAFSPDGATLASGSGDQTVRLWDISSSKCLYI 1140 1150 1160 1170 1180 1190 460 470 480 490 500 510 YIL046 FRGHVGQVQKIIPLTIKDVENLATDNTSDGSSPQDDPTMTDGADESDTPSNEQETVLDEN ..::.. :.... : .::. ::: : .... . . . .. gi|205 LQGHTSWVNSVV--FNPDGSTLAS-----GSSDQTVRLWEINSSKCLCTFQGHTSWVNSV 1200 1210 1220 1230 1240 520 530 540 550 560 570 YIL046 I--PYPTHLLSCGLDNTIKLWDVKTGKCIRTQFGHVEGVWDIA--ADNFRIISGSHDGSI . : . : : . :.:..:::....::..: ::.. : ..: :. . ::: : .. gi|205 VFNPDGSMLASGSSDKTVRLWDISSSKCLHTFQGHTNWVNSVAFNPDGSMLASGSGDQTV 1250 1260 1270 1280 1290 1300 580 590 600 610 620 630 YIL046 KVWDLQSGKCMHTFNGRRLQRETQHTQTQSLGDKVAPIACVCIGDSECFSGDEFGCVKMY ..:...:.::.:::.: gi|205 RLWEISSSKCLHTFQGHTSWVSSVTFSPDGTMLASGSDDQTVRLWSISSGECLYTFLGHT 1310 1320 1330 1340 1350 1360 >>gi|44887884|sp|Q8VBV4|FBW7_MOUSE F-box/WD-repeat prote (629 aa) initn: 949 init1: 321 opt: 536 Z-score: 613.5 bits: 123.7 E(): 3.4e-27 Smith-Waterman score: 818; 31.974% identity (35.059% ungapped) in 466 aa overlap (131-588:150-582) 110 120 130 140 150 160 YIL046 DIQFSPTHTACYKQDLKRTQEINANIAKLPLQEQSDIHHIISKYSNSNDKIRKLILDGIL .: . ... .. ... . . : :: .. gi|448 GLVPCSATPTTFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEKLLALDELI 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 YIL046 STSCFP-QLSYISSLVTHMIKIDFISILPQELSLKILSYLDCQSLCNATRVCRKWQKLAD . :: : :.... ... ... ::::.::.::.: .::.:. ..: .:...:: :. ::. gi|448 D-SCEPTQVKHMMQVIEPQFQRDFISLLPKELALYVLSFLEPKDLLQAAQTCRYWRILAE 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 YIL046 DDRVWYHMC-EQHIDRKCPNCGWGLPLLHMKRARIQQNSTGSSSNADIQTQTTRPWKVIY :. .: . : :. ::. :: :.:: .: . . : ::: : gi|448 DNLLWREKCKEEGIDE---------PL-HIKRRKIIKPGFIHS-----------PWKSAY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 YIL046 RERFKVESNWRKGHCRIQE-FKGHMDGVLT-LQFNYRLLFTGSYDSTIGIWDLFTGKLIR .. ....:::.:. . . .::: : :.: ::: . .:: :.:. .:. ::: .: gi|448 IRQHRIDTNWRRGELKSPKVLKGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWSAVTGKCLR 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 YIL046 RLSGHSDGVKTLYFDDRKLITGSLDKTIRVWNYITGECISTYRGHSDSVLSVDSYQKVIV : ::. :: . . : .:.:: :.:..::: ::::: : ::...: . ..: .: gi|448 TLVGHTGGVWSSQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCMHLHEKRVV 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 YIL046 SGSADKTVKVWHVESRTC-YTLRGHTEWVNCVKLHPKSFSCFSCSDDTTIRMWDIRTNSC ::: : :..:: .:. : ..: ::. : ::. . : . : ...:: .:..: gi|448 SGSRDATLRVWDIETGQCLHVLMGHVAAVRCVQYDGRR--VVSGAYDFMVKVWDPETETC 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 YIL046 LKVFRGHVGQVQKIIPLTIKDVENLATDNTSDGSSPQDDPTMTDGADESDTPSNEQETVL :....::...: .. :. : . . . . : . .: : . : : gi|448 LHTLQGHTNRVYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGME----L 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 YIL046 DENIPYPTHLLSCGLDNTIKLWDVKTGKCIRTQFG---HVEGVWDIAADNFRIISGSHDG .:: :.: . :.:.:.::.:::.:..: : : .: . .. .:..: :: gi|448 KDNI-----LVSGNADSTVKIWDIKTGQCLQTLQGPSKHQSAVTCLQFNKNFVITSSDDG 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 YIL046 SIKVWDLQSGKCMHTFNGRRLQRETQHTQTQSLGDKVAPIACVCIGDSECFSGDEFGCVK ..:.:::..:. .... gi|448 TVKLWDLKTGEFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEETKLLVLDFDV 570 580 590 600 610 620 >>gi|44887885|sp|Q969H0|FBW7_HUMAN F-box/WD-repeat prote (707 aa) initn: 949 init1: 321 opt: 535 Z-score: 611.7 bits: 123.6 E(): 4.3e-27 Smith-Waterman score: 819; 29.949% identity (33.586% ungapped) in 591 aa overlap (13-588:119-660) 10 20 30 40 YIL046 MRRERQRMMSFEDKDKDDLDNSN-SNNSSEMTDTAMMPPLKR :...::.:.:. :. .: : : gi|448 EDSSGNQEEQEEDEEHAGEQDEEDEEEEEMDQESDDFDQSDDSSREDEHTHTNS------ 90 100 110 120 130 140 50 60 70 80 90 YIL046 LLITGSSD--DLA--QGSSG-KKKMTMATRSPSSSPDLATNDSGTRVQPLPEYNFTKFCY .:.::. :: : :: : : :. . . .. . . : . . ::. : gi|448 --VTNSSSIVDLPVHQLSSPFYTKTTKMKRKLDHGSEVRSFSLGKKPCKVSEYTST---- 150 160 170 180 190 100 110 120 130 140 150 YIL046 RHNPDIQFSPTHTACYKQDLKRTQEINANIAKLP-LQEQSDIHHIISKYSNSNDKIRKLI . . : : :. ::. .. . . .. .: . ... .. ... . . : gi|448 --TGLVPCSATPTTF--GDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEKLLA 200 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 210 YIL046 LDGILSTSCFP-QLSYISSLVTHMIKIDFISILPQELSLKILSYLDCQSLCNATRVCRKW :: ... :: : :.... ... ... ::::.::.::.: .::.:. ..: .:...:: : gi|448 LDELID-SCEPTQVKHMMQVIEPQFQRDFISLLPKELALYVLSFLEPKDLLQAAQTCRYW 260 270 280 290 300 310 220 230 240 250 260 270 YIL046 QKLADDDRVWYHMC-EQHIDRKCPNCGWGLPLLHMKRARIQQNSTGSSSNADIQTQTTRP . ::.:. .: . : :. ::. :: :.:: .. . . : : gi|448 RILAEDNLLWREKCKEEGIDE---------PL-HIKRRKVIKPGFIHS-----------P 320 330 340 350 280 290 300 310 320 330 YIL046 WKVIYRERFKVESNWRKGHCRIQE-FKGHMDGVLT-LQFNYRLLFTGSYDSTIGIWDLFT :: : .. ....:::.:. . . .::: : :.: ::: . .:: :.:. .:. : gi|448 WKSAYIRQHRIDTNWRRGELKSPKVLKGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWSAVT 360 370 380 390 400 410 340 350 360 370 380 390 YIL046 GKLIRRLSGHSDGVKTLYFDDRKLITGSLDKTIRVWNYITGECISTYRGHSDSVLSVDSY :: .: : ::. :: . . : .:.:: :.:..::: ::::: : ::...: . . gi|448 GKCLRTLVGHTGGVWSSQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCMHLH 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 450 YIL046 QKVIVSGSADKTVKVWHVESRTC-YTLRGHTEWVNCVKLHPKSFSCFSCSDDTTIRMWDI .: .:::: : :..:: .:. : ..: ::. : ::. . : . : ...:: gi|448 EKRVVSGSRDATLRVWDIETGQCLHVLMGHVAAVRCVQYDGRR--VVSGAYDFMVKVWDP 480 490 500 510 520 460 470 480 490 500 510 YIL046 RTNSCLKVFRGHVGQVQKIIPLTIKDVENLATDNTSDGSSPQDDPTMTDGADESDTPSNE .:..::....::...: .. :. : . . . . : . .: : . : gi|448 ETETCLHTLQGHTNRVYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGME 530 540 550 560 570 580 520 530 540 550 560 YIL046 QETVLDENIPYPTHLLSCGLDNTIKLWDVKTGKCIRTQFG---HVEGVWDIAADNFRIIS : .:: :.: . :.:.:.::.:::.:..: : : .: . .. .:. gi|448 ----LKDNI-----LVSGNADSTVKIWDIKTGQCLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKNFVIT 590 600 610 620 630 570 580 590 600 610 620 YIL046 GSHDGSIKVWDLQSGKCMHTFNGRRLQRETQHTQTQSLGDKVAPIACVCIGDSECFSGDE .: ::..:.:::..:. .... gi|448 SSDDGTVKLWDLKTGEFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEETKLLV 640 650 660 670 680 690 640 residues in 1 query sequences 55022948 residues in 149755 library sequences Scomplib [34t23] start: Sun Feb 27 17:41:04 2005 done: Sun Feb 27 17:41:17 2005 Total Scan time: 12.070 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [version 3.4t23 March 18, 2004]